| 種 別 | 番号 | 名 称 | 時 代 | 所 在 地 | 管 理 者 |
| 史 跡 | 34 | 南門の土塁 | 江 戸 | 大手町 | 東光寺 |
| 35 | 荒川沖の一里塚 | 江 戸 | 荒川沖町 | 土浦教育委員会 | |
| 36 | 中峰和尚と復庵和尚の 墓碑地域  |
中世〜近世 | 高 岡 | 法雲寺 | |
| 37 | 辻元順の墓 | 江戸〜明治 | 大手町 | 東光寺 | |
| 38 | 安村江痴の墓 | 江戸〜明治 | 沖宿町(観音山墓地) | 個 人 | |
| 39 | 武者塚一号墳石室 | 古 墳 | 上坂田 | 上坂田 | |
| 40 | 后塚古墳 | 古 墳 | 手野町 | 個 人 | |
| 41 | 正東院一字一石経塚 | 江 戸 | 手野町(正東院墓地) | 正東院責任役人 | |
| 42 | 常名天神山古墳 | 古 墳 | 常名町 | 常名神社代表役員 | |
| 43 | 今泉愛宕山古墳 | 古 墳 | 今泉町 | 個 人 | |
| 名 勝 | 1 | 法雲寺境内庭園 | 室町〜江戸 | 高 岡 | 法雲寺 |
| 2 | 向上庵境内庭園 | 室町〜江戸 | 小 野 | 向上庵 | |
| 天然記念物 | 1 | 岩瀬家のシイ | - | 小山崎町 | 個 人 |
| 2 | 稲荷山のベニヤマザクラ | - | 板谷4丁目(稲荷神社) | 板谷町 | |
| 3 | 下高津のコブシ | - | 下高津一丁目 (沼地公園) |
土浦市 | |
| 4 | 百日紅 | - | 藤沢 | 神宮寺 | |
| 5 | 法泉寺のシイ | - | 今泉 | 法泉寺 | |
| 6 | 常福寺のイチョウ | - | 下高津二丁目 | 常福寺 | |
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